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东莞位于珠江口东岸，握东江和狮子洋出海之咽喉，处于穗深港经济走廊中段，是广州与香港之间水陆交通的要道。东莞市海域集中分布于狮子洋、伶仃洋东北部，海域面积82.57平方千米，岸线长112.20千米，拥有海岸线的有中堂、麻涌、洪梅、道滘、厚街、沙田、虎门和长安8个镇。
东莞地处南亚热带浅海区，水域生境多样，生物区系复杂，是多种经济鱼、虾、藻类的繁育场，有鱼类88种、贝类18种、甲壳类21种。东莞太平海域是国家二级保护水生野生动物黄唇鱼的重要繁殖场，设有全国唯一的黄唇鱼自然保护区，面积686公顷。
东莞有威远岛、泥洲岛、木棉山岛、涌口沙、虾缯排5个海岛，海岛岸线长34.67千米，海岛面积25.86平方千米。
